La Universidad Nacional de Moreno organiza los procesos de conducción y gestión en base a siete secretarias dependientes del Rectorado:
Secretaría General
Secretaría Académica
Secretaría de Investigación y Vinculación Tecnológica
Secretaria de Extensión Universitaria
Secretaria de Administración
Secretaria Legal y Técnica
Secretaria de tecnología de la Información y Comunicación
Cada una de estas Secretarías que integran la Estructura de la UNM (Aprobada por Resoluciones UNM-CS Nº 813/21 y UNM-R N° 78/211) se diferencian en objetivos, actividades y responsabilidades, de manera de alinear sus respectivas capacidades de gestión con las necesidades de funcionamiento universitario.
